MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 10887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	ATT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012730	TTTA	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012730	TGT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012730	TGT	2	6	943	948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012730	ATTT	2	8	1362	1369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012730	GTT	2	6	6022	6027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012730	T	7	7	6289	6295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012730	TAT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012730	TTC	2	6	6328	6333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012730	TAA	2	6	6382	6387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012730	CTT	2	6	6402	6407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012730	GTT	2	6	6429	6434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012730	AT	3	6	6439	6444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012730	T	6	6	6472	6477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012730	ATTT	2	8	6520	6527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012730	TCC	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012730	TAAA	2	8	6616	6623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012730	TCT	2	6	7876	7881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012730	AAT	2	6	7919	7924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012730	T	6	6	7963	7968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012730	T	7	7	7973	7979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012730	GCT	2	6	8001	8006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012730	GAC	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012730	CAA	3	9	8032	8040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012730	TA	3	6	9133	9138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012730	TAT	2	6	9150	9155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012730	CAA	2	6	9157	9162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012730	ATG	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012730	AGC	2	6	9218	9223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012730	ATA	2	6	9250	9255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012730	CAA	2	6	9325	9330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012730	A	7	7	9356	9362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012730	AAG	2	6	9400	9405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012730	AATTA	2	10	9406	9415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012730	AT	3	6	9416	9421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012730	T	6	6	9430	9435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012730	T	6	6	9454	9459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012730	TAA	2	6	9512	9517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012730	TAA	2	6	9530	9535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012730	GGT	2	6	9602	9607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012730	A	7	7	9667	9673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012730	AGT	2	6	9683	9688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012730	GGT	2	6	9699	9704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012730	GCT	2	6	9711	9716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012730	GAA	2	6	9744	9749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012730	TAA	2	6	9779	9784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012730	AGA	2	6	9863	9868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012730	A	6	6	9886	9891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012730	TAT	2	6	10496	10501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012730	AAC	2	6	10502	10507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012730	TTG	2	6	10610	10615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012730	ATC	2	6	10716	10721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012730	GTT	2	6	10736	10741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012730	AGGT	2	8	10821	10828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012730	ACT	2	6	10870	10875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012730	TTG	2	6	10885	10890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012730	CTG	2	6	10959	10964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012730	T	6	6	10976	10981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012730	T	6	6	10990	10995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012730	ATA	2	6	10999	11004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012730	TTA	2	6	11010	11015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012730	TAT	2	6	11029	11034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012730	T	6	6	11070	11075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012730	TAA	2	6	11085	11090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012730	CTA	2	6	11120	11125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012730	TCTA	2	8	11876	11883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012730	AGT	2	6	11907	11912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012730	CTA	2	6	11981	11986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012730	CTT	2	6	11987	11992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012730	ATT	2	6	12049	12054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012730	TAT	3	9	12107	12115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012730	TACCC	2	10	12142	12151	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_012730	TTC	2	6	12179	12184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012730	ATA	2	6	12185	12190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012730	CTT	2	6	12234	12239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012730	T	6	6	12273	12278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012730	ATA	2	6	12290	12295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012730	TTC	2	6	12305	12310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012730	AT	3	6	12356	12361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012730	ATT	2	6	12363	12368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012730	GAT	2	6	12369	12374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012730	T	6	6	12376	12381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012730	TTC	2	6	12404	12409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012730	ATA	2	6	12419	12424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012730	TTCT	2	8	12425	12432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012730	TTG	2	6	12455	12460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012730	TA	3	6	12482	12487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012730	A	7	7	12495	12501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012730	AT	3	6	12534	12539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012730	AAT	2	6	12564	12569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012730	ATA	2	6	12587	12592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012730	T	7	7	12593	12599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012730	A	6	6	12886	12891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012730	A	7	7	12920	12926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012730	TAT	2	6	12956	12961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012730	TAG	2	6	12998	13003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012730	CTTTAA	2	12	13076	13087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012730	GAC	2	6	13093	13098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012730	CGTC	2	8	13110	13117	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012730	T	6	6	13125	13130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012730	CTT	2	6	13132	13137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012730	CT	3	6	13155	13160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012730	GAA	2	6	13175	13180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012730	TCT	2	6	13191	13196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012730	ATT	2	6	13280	13285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012730	GTA	2	6	13333	13338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012730	ATA	2	6	13377	13382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012730	AG	3	6	13395	13400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012730	CCG	2	6	13410	13415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012730	T	6	6	13452	13457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012730	T	6	6	13486	13491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012730	TACCG	2	10	13503	13512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_012730	ATC	2	6	13554	13559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012730	ATT	2	6	13561	13566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012730	T	7	7	13565	13571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012730	T	6	6	13575	13580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012730	ATT	2	6	13603	13608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012730	TA	3	6	13625	13630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012730	ATA	2	6	13710	13715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012730	GCT	2	6	13716	13721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012730	TCT	2	6	13754	13759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012730	AAT	2	6	13768	13773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012730	TA	3	6	13795	13800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012730	T	6	6	13802	13807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012730	GAG	2	6	13844	13849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012730	TATAA	2	10	13857	13866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012730	TTA	3	9	15295	15303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012730	GTAA	2	8	15347	15354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012730	ATT	2	6	15423	15428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012730	TATG	2	8	15455	15462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012730	AAC	2	6	15475	15480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012730	TAT	3	9	15573	15581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012730	TGC	2	6	15592	15597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012730	GAC	2	6	15622	15627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012730	CTT	2	6	15637	15642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012730	AATC	2	8	15659	15666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012730	TAA	2	6	15748	15753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012730	TCT	2	6	15821	15826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012730	AT	3	6	15830	15835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012730	AT	3	6	15842	15847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012730	ATT	2	6	15883	15888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012730	ATT	2	6	15898	15903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012730	ATT	2	6	15922	15927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012730	CTG	2	6	15930	15935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012730	TAT	2	6	16002	16007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012730	TCA	2	6	16013	16018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_012730	AG	3	6	16019	16024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012730	TTTGA	2	10	16038	16047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012730	AATG	2	8	16055	16062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012730	T	6	6	16128	16133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012730	TA	3	6	16153	16158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012730	TAA	2	6	16171	16176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012730	CAA	2	6	16203	16208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_012730	GCTT	2	8	16216	16223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_012730	TAG	2	6	16353	16358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012730	CTT	2	6	16395	16400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_012730	TTTA	2	8	16420	16427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012730	CCG	2	6	16499	16504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_012730	T	6	6	16529	16534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012730	TCA	2	6	16541	16546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_012730	ATG	2	6	16558	16563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012730	TA	3	6	16582	16587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012730	AT	3	6	16714	16719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012730	GCC	3	9	16777	16785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_012730	ATT	3	9	16804	16812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012730	TTTTC	2	10	16817	16826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_012730	AAAT	2	8	16876	16883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012730	TTCTTG	2	12	16885	16896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_012730	AGGATA	2	12	16912	16923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012730	GTA	2	6	16967	16972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012730	T	6	6	16973	16978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012730	ATT	3	9	17001	17009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012730	T	6	6	17008	17013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012730	GTT	2	6	17016	17021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012730	TA	4	8	17024	17031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012730	TTA	2	6	18810	18815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012730	TTG	2	6	18855	18860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_012730	GAC	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_012730	TTG	2	6	21427	21432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012730	TTA	2	6	21433	21438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012730	GAG	2	6	21450	21455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012730	CT	3	6	21513	21518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_012730	ATT	2	6	22058	22063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012730	TAT	2	6	22085	22090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_012730	TTATT	2	10	22121	22130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012730	TAAA	2	8	22143	22150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_012730	T	6	6	22514	22519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012730	TA	3	6	22526	22531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_012730	AT	3	6	22532	22537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012730	T	6	6	22548	22553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_012730	AATT	2	8	22563	22570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012730	T	9	9	22578	22586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_012730	AGTA	2	8	29531	29538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_012730	TTGC	2	8	29563	29570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_012730	ATTT	2	8	29623	29630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_012730	TA	3	6	29655	29660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_012730	GCA	2	6	30444	30449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_012730	AGC	2	6	30492	30497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_012730	GAA	2	6	30536	30541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_012730	TTAT	2	8	31366	31373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_012730	TGG	2	6	31482	31487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_012730	TAA	2	6	31723	31728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012730	TAT	2	6	31802	31807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_012730	TTA	2	6	31887	31892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_012730	TAA	2	6	31949	31954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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